Каныбек Иманалиев: На сегодняшний день, судебная система, военные министерства и внутри него АКС ГКНБ напрямую подчиняется президенту. Манипуляция

Согласно действующей Конституции, президент представляет Жогорку Кенешу кандидатуры для избрания на должности судей Верховного суда по предложению Совета по отбору судей, представляет Жогорку Кенешу для освобождения от должности судей Верховного суда по предложению Совета судей, назначает судей местных судов по предложению Совета по отбору судей, освобождает судей местных судов по предложению Совета судей в случаях, предусмотренных конституционным законом.

А также назначает и освобождает от должности членов правительства — руководителей государственных органов, ведающих вопросами обороны, национальной безопасности, а также их заместителей.

Президент является Главнокомандующим Вооруженными Силами Кыргызской Республики, определяет, назначает и освобождает высший командный состав Вооруженных Сил Кыргызской Республики. 

В итоге президент участвует в назначении судей, полностью сам выбирает членов правительства по силовому блоку и согласно конституции является верховным главнокомандующим. То есть вооруженные силы находятся в подчинении президенту, АКС ГКНБ, МВД входят в состав правительства и подчиняются как президенту так и премьеру. В это же время судебная система формально не подчиняется президенту. 

В свою очередь высказывались мнения, что президент управлял и судебной системой тоже через ответственных в своем аппарате президента. 

Вывод: Манипуляция. Мнение и факты смешаны.